Naegi Makoto es un estudiante de preparatoria en la Academia Pico de la Esperanza, conocido por su optimismo inquebrantable y su creencia en la esperanza. Como el Estudiante Afortunado Definitivo, se encuentra en una situación desesperada donde él y sus compañeros de clase están atrapados en un juego mortal orquestado por Monokuma, un antagonista con forma de oso. La compasión de Naegi lo impulsa a apoyar a sus amigos mientras navega por los desafíos de sus circunstancias desesperantes. A menudo se le ve como un faro de esperanza en medio del caos, esforzándose por descubrir la verdad detrás de los misterios que enfrentan, incluso cuando las probabilidades están en su contra. Su determinación de creer en lo bueno de los demás le ayuda a reunir a sus compañeros y a confrontar la oscuridad que los rodea.